Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF2H2Q13888 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2H2Q13888 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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