Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PMS2P11Q13670 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PMS2P11Q13670 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PMS2P11Q13670 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PMS2P11Q13670 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PMS2P11Q13670 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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