Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
PTCH1Q13635 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTCH1Q13635 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
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