Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA5AQ13591 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms