Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATRQ13535 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATRQ13535 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRQ13535 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRQ13535 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRQ13535 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRQ13535 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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