Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOP3AQ13472 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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