Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PMS2P3Q13401 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PMS2P3Q13401 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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