Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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SGCGQ13326 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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