Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUSP4Q13115 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUSP4Q13115 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUSP4Q13115 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUSP4Q13115 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUSP4Q13115 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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