Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAF3Q13114 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
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TRAF3Q13114 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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TRAF3Q13114 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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TRAF3Q13114 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAF3Q13114 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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