Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKRN3Q13064 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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