Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPN13Q12923 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPN13Q12923 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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