Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCB1Q12824 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMARCB1Q12824 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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