Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
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KCNH2Q12809 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNH2Q12809 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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