Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TFCP2Q12800 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFCP2Q12800 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms