Protein–RNA interactions for Protein: Q12324

YVC1, Calcium channel YVC1, yeastyeast

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YVC1Q12324 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YER138CYER138C 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YER160CYER160C 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YJR027WYJR027W 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YML039WYML039W 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YML045WYML045W 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YMR050CYMR050C 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 ECM29YHL030W 5607 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 VPS35YJL154C 2835 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YEL043WYEL043W 2871 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 RIX1YHR197W 2292 nt2.91□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 INP2YMR163C 2118 nt2.9□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 AI2Q0055 2565 nt2.9□□□□□ -1.94
YVC1Q12324 YEL073CYEL073C 324 nt2.9□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 RGM1YMR182C 636 nt2.9□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 PTC5YOR090C 1719 nt2.9□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YIL169CYIL169C 2988 nt2.9□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 GEA1YJR031C 4227 nt2.89□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 ECM12YHR021W-A 456 nt2.89□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 UBP11YKR098C 2154 nt2.89□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 RGC1YPR115W 3252 nt2.89□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 SEC7YDR170C 6030 nt2.89□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 VPS34YLR240W 2628 nt2.89□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 UTP14YML093W 2700 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 PMP1YCR024C-A 123 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YHR210CYHR210C 1026 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YOR218CYOR218C 420 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 ACM1YPL267W 630 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YLR149CYLR149C 2193 nt2.88□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YBR184WYBR184W 1572 nt2.87□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 UBP15YMR304W 3693 nt2.87□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 PSY2YNL201C 2577 nt2.87□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 snR76snR76 109 nt2.87□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YLR012CYLR012C 300 nt2.87□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YPL216WYPL216W 3309 nt2.87□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 MPT5YGL178W 2580 nt2.87□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 SEF1YBL066C 3447 nt2.86□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 GRR1YJR090C 3456 nt2.86□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 CYR1YJL005W 6081 nt2.86□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 KSP1YHR082C 3090 nt2.86□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YHL005CYHL005C 393 nt2.85□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.85□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 PXA2YKL188C 2562 nt2.85□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 CLN3YAL040C 1743 nt2.85□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 YGR067CYGR067C 2415 nt2.84□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 SIR3YLR442C 2937 nt2.84□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 RRP12YPL012W 3687 nt2.84□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.84□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.84□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 RPL20AYMR242C 519 nt2.84□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 RPL33BYOR234C 324 nt2.84□□□□□ -1.95
YVC1Q12324 PRP8YHR165C 7242 nt2.84□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 MCM10YIL150C 1716 nt2.83□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 YDR544CYDR544C 429 nt2.83□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 RPL6AYML073C 531 nt2.83□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 ISW1YBR245C 3390 nt2.83□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 ROG1YGL144C 2058 nt2.83□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 SRO77YBL106C 3033 nt2.82□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 SLH1YGR271W 5904 nt2.82□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 YPR089WYPR089W 2667 nt2.82□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 SMY1YKL079W 1971 nt2.82□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 RPS22AYJL190C 393 nt2.82□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 SNF5YBR289W 2718 nt2.82□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 DNL4YOR005C 2835 nt2.82□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 CSF1YLR087C 8877 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 ESL2YKR096W 3588 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 YIR044CYIR044C 186 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 YMR326CYMR326C 309 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 RPB10YOR210W 213 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 YOR345CYOR345C 351 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 RPS12YOR369C 432 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 ILS1YBL076C 3219 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 IKI3YLR384C 4050 nt2.81□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.8□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 SWI6YLR182W 2412 nt2.8□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 snR72snR72 98 nt2.79□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 TFB5YDR079C-A 219 nt2.79□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 NOP10YHR072W-A 177 nt2.79□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 snR43snR43 209 nt2.79□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 PEP3YLR148W 2757 nt2.79□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 HRD3YLR207W 2502 nt2.78□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 ELG1YOR144C 2376 nt2.78□□□□□ -1.96
YVC1Q12324 FMP16YDR070C 282 nt2.77□□□□□ -1.97
YVC1Q12324 RPL23BYER117W 414 nt2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.8 ms