Protein–RNA interactions for Protein: Q12090

REX3, RNA exonuclease 3, yeastyeast

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REX3Q12090 TIM18YOR297C 579 nt1.36□□□□□ -2.19
REX3Q12090 SVS1YPL163C 783 nt1.36□□□□□ -2.19
REX3Q12090 YPR099CYPR099C 357 nt1.36□□□□□ -2.19
REX3Q12090 YBP1YBR216C 2025 nt1.35□□□□□ -2.19
REX3Q12090 SMC4YLR086W 4257 nt1.35□□□□□ -2.19
REX3Q12090 ZIP1YDR285W 2628 nt1.35□□□□□ -2.19
REX3Q12090 RAD9YDR217C 3930 nt1.34□□□□□ -2.19
REX3Q12090 RVS161YCR009C 798 nt1.34□□□□□ -2.19
REX3Q12090 MET32YDR253C 576 nt1.34□□□□□ -2.19
REX3Q12090 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.34□□□□□ -2.2
REX3Q12090 PAN3YKL025C 2040 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 CCH1YGR217W 6120 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 SWI5YDR146C 2130 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 PRM8YGL053W 714 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YSY6YBR162W-A 198 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 SGO1YOR073W 1773 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 MAD1YGL086W 2250 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 TOF2YKR010C 2316 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 SHE9YDR393W 1371 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 RAD50YNL250W 3939 nt1.33□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.32□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.32□□□□□ -2.2
REX3Q12090 NOP15YNL110C 663 nt1.32□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YOL159CYOL159C 516 nt1.32□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YPR039WYPR039W 336 nt1.32□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YPR063CYPR063C 423 nt1.32□□□□□ -2.2
REX3Q12090 PHR1YOR386W 1698 nt1.32□□□□□ -2.2
REX3Q12090 PBY1YBR094W 2262 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 VPS54YDR027C 2670 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 CDC36YDL165W 576 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YDL211CYDL211C 1119 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YJR141WYJR141W 1044 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YKL123WYKL123W 381 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 RPL9BYNL067W 576 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 IRC16YPR038W 360 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 IML1YJR138W 4755 nt1.31□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YGR130CYGR130C 2451 nt1.3□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YGL217CYGL217C 342 nt1.3□□□□□ -2.2
REX3Q12090 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.3□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.3□□□□□ -2.2
REX3Q12090 ILM1YJR118C 612 nt1.3□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YBR032WYBR032W 303 nt1.3□□□□□ -2.2
REX3Q12090 PAU2YEL049W 363 nt1.29□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.29□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.29□□□□□ -2.2
REX3Q12090 SLX4YLR135W 2247 nt1.29□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YDL016CYDL016C 303 nt1.28□□□□□ -2.2
REX3Q12090 YOP1YPR028W 543 nt1.28□□□□□ -2.2
REX3Q12090 GDS1YOR355W 1569 nt1.27□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YDR509WYDR509W 348 nt1.27□□□□□ -2.21
REX3Q12090 SWI4YER111C 3282 nt1.27□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YDR008CYDR008C 351 nt1.26□□□□□ -2.21
REX3Q12090 APQ13YJL075C 417 nt1.26□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YLL020CYLL020C 306 nt1.26□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YML003WYML003W 873 nt1.26□□□□□ -2.21
REX3Q12090 SPO75YLL005C 2607 nt1.26□□□□□ -2.21
REX3Q12090 NOC3YLR002C 1992 nt1.25□□□□□ -2.21
REX3Q12090 snR84snR84 550 nt1.25□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.25□□□□□ -2.21
REX3Q12090 TMA22YJR014W 597 nt1.25□□□□□ -2.21
REX3Q12090 NUT1YGL151W 3399 nt1.25□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YDR114CYDR114C 303 nt1.24□□□□□ -2.21
REX3Q12090 SWI6YLR182W 2412 nt1.24□□□□□ -2.21
REX3Q12090 AHC1YOR023C 1701 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 NST1YNL091W 3723 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 UBX4YMR067C 1251 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 MKT1YNL085W 2493 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 PIG1YLR273C 1947 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 NUP145YGL092W 3954 nt1.23□□□□□ -2.21
REX3Q12090 MXR1YER042W 555 nt1.22□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.22□□□□□ -2.21
REX3Q12090 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.22□□□□□ -2.21
REX3Q12090 NUP188YML103C 4968 nt1.22□□□□□ -2.21
REX3Q12090 SPT21YMR179W 2277 nt1.22□□□□□ -2.21
REX3Q12090 SNU56YDR240C 1479 nt1.21□□□□□ -2.22
REX3Q12090 YAP3YHL009C 993 nt1.21□□□□□ -2.22
REX3Q12090 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.21□□□□□ -2.22
REX3Q12090 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.21□□□□□ -2.22
REX3Q12090 SPO23YBR250W 1572 nt1.21□□□□□ -2.22
REX3Q12090 AIM44YPL158C 2277 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 LYS14YDR034C 2373 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 YDR029WYDR029W 315 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 RTR1YER139C 681 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 snR13snR13 124 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 YLR419WYLR419W 4308 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 UBP3YER151C 2739 nt1.2□□□□□ -2.22
REX3Q12090 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.19□□□□□ -2.22
REX3Q12090 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.19□□□□□ -2.22
REX3Q12090 BIG1YHR101C 1008 nt1.19□□□□□ -2.22
REX3Q12090 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.18□□□□□ -2.22
REX3Q12090 YGR283CYGR283C 1026 nt1.18□□□□□ -2.22
REX3Q12090 HIT1YJR055W 495 nt1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.9 ms