Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LMOD3Q0VAK6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LMOD3Q0VAK6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms