Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PDE4CQ08493 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4CQ08493 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms