Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 YIL059CYIL059C 366 nt2.61□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 CYB5YNL111C 363 nt2.61□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 AXL1YPR122W 3627 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 BFA1YJR053W 1725 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 HDA3YPR179C 1968 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 UTP14YML093W 2700 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 NUM1YDR150W 8247 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 FMP16YDR070C 282 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YLR255CYLR255C 354 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 ESL2YKR096W 3588 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 SGM1YJR134C 2124 nt2.6□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 BNR1YIL159W 4128 nt2.59□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 NOP10YHR072W-A 177 nt2.59□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 UPS1YLR193C 528 nt2.59□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.59□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 SNC2YOR327C 348 nt2.59□□□□□ -1.99
SGO1Q08490 SSQ1YLR369W 1974 nt2.59□□□□□ -2
SGO1Q08490 REV3YPL167C 4515 nt2.59□□□□□ -2
SGO1Q08490 SCP160YJL080C 3669 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 TRA1YHR099W 11235 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 YGR250CYGR250C 2346 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 PAN3YKL025C 2040 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 SCW11YGL028C 1629 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 VTC1YER072W 390 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 ACB1YGR037C 264 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 RPL38YLR325C 237 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 RRP12YPL012W 3687 nt2.58□□□□□ -2
SGO1Q08490 DFG16YOR030W 1860 nt2.57□□□□□ -2
SGO1Q08490 YGL052WYGL052W 306 nt2.57□□□□□ -2
SGO1Q08490 YJL150WYJL150W 303 nt2.57□□□□□ -2
SGO1Q08490 INP53YOR109W 3324 nt2.57□□□□□ -2
SGO1Q08490 TRS65YGR166W 1683 nt2.57□□□□□ -2
SGO1Q08490 ISW1YBR245C 3390 nt2.57□□□□□ -2
SGO1Q08490 INP51YIL002C 2841 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 MDM20YOL076W 2391 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 VPS16YPL045W 2397 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 ACM1YPL267W 630 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 SIR3YLR442C 2937 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 RTT10YPL183C 3042 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 TMN3YER113C 2121 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 TOF2YKR010C 2316 nt2.56□□□□□ -2
SGO1Q08490 CBF2YGR140W 2871 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 YDR426CYDR426C 378 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 YOR015WYOR015W 360 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 YOR170WYOR170W 306 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 YBR277CYBR277C 402 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 VMA9YCL005W-A 222 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 SPO22YIL073C 2928 nt2.55□□□□□ -2
SGO1Q08490 CSF1YLR087C 8877 nt2.54□□□□□ -2
SGO1Q08490 PCC1YKR095W-A 267 nt2.54□□□□□ -2
SGO1Q08490 YMR321CYMR321C 318 nt2.54□□□□□ -2
SGO1Q08490 NUT2YPR168W 474 nt2.54□□□□□ -2
SGO1Q08490 MET6YER091C 2304 nt2.54□□□□□ -2
SGO1Q08490 ALK2YBL009W 2031 nt2.54□□□□□ -2
SGO1Q08490 APL5YPL195W 2799 nt2.54□□□□□ -2
SGO1Q08490 MLH1YMR167W 2310 nt2.53□□□□□ -2
SGO1Q08490 MRD1YPR112C 2664 nt2.53□□□□□ -2
SGO1Q08490 YNL028WYNL028W 318 nt2.53□□□□□ -2
SGO1Q08490 PDR1YGL013C 3207 nt2.52□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.52□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 CSE2YNR010W 450 nt2.52□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YGR050CYGR050C 357 nt2.51□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 BCK1YJL095W 4437 nt2.51□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 TUS1YLR425W 3924 nt2.51□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 VIK1YPL253C 1944 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 IRR1YIL026C 3453 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 HSC82YMR186W 2118 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 TAE2YPL009C 3117 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 SSS1YDR086C 243 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YNL170WYNL170W 396 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YOR333CYOR333C 417 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 SEC26YDR238C 2922 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YLR149CYLR149C 2193 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 KAP123YER110C 3342 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 TRS130YMR218C 3309 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 PRP39YML046W 1890 nt2.5□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YEL043WYEL043W 2871 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YEL014CYEL014C 306 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 INA22YIR024C 651 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 YBR224WYBR224W 516 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 RIC1YLR039C 3171 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 STB4YMR019W 2850 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 LCD1YDR499W 2244 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 CDC53YDL132W 2448 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 ARP8YOR141C 2646 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 PEX8YGR077C 1770 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 SWR1YDR334W 4545 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 NOP53YPL146C 1368 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 IRA2YOL081W 9240 nt2.49□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 RPO41YFL036W 4056 nt2.48□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 CDC27YBL084C 2277 nt2.48□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 SNC1YAL030W 354 nt2.48□□□□□ -2.01
SGO1Q08490 ATP7YKL016C 525 nt2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms