Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CXCL9Q07325 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms