Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNDQ07001 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNDQ07001 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms