Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 HCS1YKL017C 2052 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YOR093CYOR093C 4947 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 PDR8YLR266C 2106 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 PEP1YBL017C 4740 nt1.56□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YPL238CYPL238C 390 nt1.56□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 IRE1YHR079C 3348 nt1.56□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 DAS1YJL149W 1992 nt1.56□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 NUP120YKL057C 3114 nt1.55□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 PEX8YGR077C 1770 nt1.55□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.55□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.55□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 RPS27AYKL156W 249 nt1.55□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.55□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 MSH6YDR097C 3729 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YDL011CYDL011C 324 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YHR138CYHR138C 345 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YAR047CYAR047C 321 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 COA6YMR244C-A 315 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 FMP23YBR047W 528 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 ATG9YDL149W 2994 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 MYO2YOR326W 4725 nt1.54□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.53□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 IRC20YLR247C 4671 nt1.53□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.53□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 BUD2YKL092C 3315 nt1.53□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 SEC63YOR254C 1992 nt1.52□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 RPA34YJL148W 702 nt1.52□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.52□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YLR434CYLR434C 384 nt1.52□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 BSC3YLR465C 309 nt1.52□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 RPL9BYNL067W 576 nt1.52□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YNL114CYNL114C 372 nt1.52□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 FRK1YPL141C 2598 nt1.51□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 PAU3YCR104W 375 nt1.51□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 TIM13YGR181W 318 nt1.51□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YBL073WYBL073W 312 nt1.51□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 SEY1YOR165W 2331 nt1.51□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 SWI5YDR146C 2130 nt1.51□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 CFT2YLR115W 2580 nt1.51□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 DCP2YNL118C 2913 nt1.5□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.5□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.5□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 HSH155YMR288W 2916 nt1.5□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 CTR9YOL145C 3234 nt1.5□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YGR250CYGR250C 2346 nt1.5□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 PKH3YDR466W 2697 nt1.5□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 ATG11YPR049C 3537 nt1.49□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YBP1YBR216C 2025 nt1.49□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 WIP1YDR374W-A 270 nt1.49□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 RPL32YBL092W 393 nt1.49□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YPR012WYPR012W 255 nt1.49□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 PCF11YDR228C 1881 nt1.49□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 RKM1YPL208W 1752 nt1.49□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 GUP1YGL084C 1683 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 MAK10YEL053C 2202 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 SWI6YLR182W 2412 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 AIM9YER080W 1884 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YDR008CYDR008C 351 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 PHS1YJL097W 654 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 HDA3YPR179C 1968 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 HMI1YOL095C 2121 nt1.48□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YNL144CYNL144C 2223 nt1.47□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 HMRA1YCR097W 381 nt1.47□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YKL083WYKL083W 615 nt1.47□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 HHT1YBR010W 411 nt1.47□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YPL229WYPL229W 621 nt1.47□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 YBR174CYBR174C 315 nt1.47□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 IRR1YIL026C 3453 nt1.47□□□□□ -2.17
YHC1Q05900 MSC6YOR354C 2079 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YAP6YDR259C 1152 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YGR265WYGR265W 411 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 MCM22YJR135C 720 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 PAU18YLL064C 363 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YLR334CYLR334C 381 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 HCH1YNL281W 462 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 PAU6YNR076W 363 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YCL046WYCL046W 324 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YJR039WYJR039W 3366 nt1.46□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 RLM1YPL089C 2031 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 VPS15YBR097W 4365 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 HIT1YJR055W 495 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 RPL26AYLR344W 384 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YOR121CYOR121C 306 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 NOP53YPL146C 1368 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 HSL1YKL101W 4557 nt1.45□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 HIR3YJR140C 4947 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 OSH6YKR003W 1347 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 EFR3YMR212C 2349 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 ISF1YMR081C 1017 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 ZRG17YNR039C 1818 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 TRM3YDL112W 4311 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 ZIP1YDR285W 2628 nt1.44□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 DNF3YMR162C 4971 nt1.43□□□□□ -2.18
YHC1Q05900 snR56snR56 88 nt1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.1 ms