Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBE1Q04446 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms