Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XPCQ01831 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XPCQ01831 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
XPCQ01831 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
XPCQ01831 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
XPCQ01831 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
XPCQ01831 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPCQ01831 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
XPCQ01831 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
XPCQ01831 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XPCQ01831 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XPCQ01831 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XPCQ01831 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XPCQ01831 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms