Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MS4A2Q01362 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MS4A2Q01362 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms