Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNAQ00169 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PITPNAQ00169 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms