Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX6P78412 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX6P78412 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX6P78412 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX6P78412 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX6P78412 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX6P78412 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX6P78412 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX6P78412 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms