Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HERVK_113P63121 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms