Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HERVK_113P61574 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HERVK_113P61574 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms