Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ACTBP60709 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ACTBP60709 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTBP60709 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTBP60709 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms