Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVFC1P60507 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ERVFC1P60507 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms