Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP6P59044 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRP6P59044 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms