Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TPTEP56180 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTEP56180 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTEP56180 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTEP56180 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTEP56180 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTEP56180 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TPTEP56180 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TPTEP56180 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TPTEP56180 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms