Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAX9P55771 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PAX9P55771 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAX9P55771 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms