Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP6P55212 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP6P55212 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP6P55212 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP6P55212 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP6P55212 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CASP6P55212 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CASP6P55212 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CASP6P55212 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP6P55212 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms