Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP7P55210 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP7P55210 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP7P55210 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP7P55210 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP7P55210 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP7P55210 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP7P55210 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP7P55210 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CASP7P55210 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms