Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMTNP53814 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMTNP53814 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMTNP53814 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMTNP53814 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMTNP53814 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMTNP53814 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMTNP53814 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms