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Protein–RNA interactions for Protein: P52918
MSN5, Protein MSN5, yeast
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1,224 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSN5
P52918
MPH1
YIR002C
2982 nt
3.4
□□□□□ -1.86
MSN5
P52918
NUP120
YKL057C
3114 nt
3.4
□□□□□ -1.86
MSN5
P52918
ENA5
YDR038C
3276 nt
3.4
□□□□□ -1.86
MSN5
P52918
YGL014C-A
YGL014C-A
162 nt
3.4
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
MCM10
YIL150C
1716 nt
3.4
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
GRX8
YLR364W
330 nt
3.4
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
PTC5
YOR090C
1719 nt
3.4
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
SGS1
YMR190C
4344 nt
3.4
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
RIF1
YBR275C
5751 nt
3.39
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YDL242W
YDL242W
354 nt
3.39
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YLR154W-A
YLR154W-A
186 nt
3.39
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
COY1
YKL179C
2040 nt
3.39
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
VPS3
YDR495C
3036 nt
3.38
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YDL025W-A
YDL025W-A
105 nt
3.38
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YDR182W-A
YDR182W-A
204 nt
3.38
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
SIZ1
YDR409W
2715 nt
3.38
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
SIR3
YLR442C
2937 nt
3.37
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
RAX2
YLR084C
3663 nt
3.37
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
RRM3
YHR031C
2172 nt
3.37
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
SBH1
YER087C-B
249 nt
3.37
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
TFC1
YBR123C
1950 nt
3.37
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YIL169C
YIL169C
2988 nt
3.37
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
VPS34
YLR240W
2628 nt
3.36
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YHL015W-A
YHL015W-A
84 nt
3.36
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YOR102W
YOR102W
351 nt
3.36
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YLR149C
YLR149C
2193 nt
3.35
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
NMD2
YHR077C
3270 nt
3.35
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YSP2
YDR326C
4317 nt
3.35
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
snR61
snR61
90 nt
3.35
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YER053C-A
YER053C-A
114 nt
3.35
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
RSN1
YMR266W
2862 nt
3.35
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YDR341C
YDR341C
1824 nt
3.35
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
NAB3
YPL190C
2409 nt
3.34
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
CHS2
YBR038W
2892 nt
3.34
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YNL067W-B
YNL067W-B
141 nt
3.34
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YOR072W-B
YOR072W-B
162 nt
3.34
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
YBR099C
YBR099C
384 nt
3.34
□□□□□ -1.87
MSN5
P52918
KAP104
YBR017C
2757 nt
3.34
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
SAK1
YER129W
3429 nt
3.34
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
FKS3
YMR306W
5358 nt
3.33
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YPL216W
YPL216W
3309 nt
3.33
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
EMC6
YLL014W
327 nt
3.33
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
ELG1
YOR144C
2376 nt
3.33
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
GRR1
YJR090C
3456 nt
3.33
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
VPS35
YJL154C
2835 nt
3.33
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
NPR3
YHL023C
3441 nt
3.32
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
DIA2
YOR080W
2199 nt
3.32
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
CSR2
YPR030W
3366 nt
3.32
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
SMC2
YFR031C
3513 nt
3.32
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
DRS2
YAL026C
4068 nt
3.31
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
TCB2
YNL087W
3537 nt
3.31
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
PXA2
YKL188C
2562 nt
3.31
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
RLM1
YPL089C
2031 nt
3.31
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
FUN30
YAL019W
3396 nt
3.31
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
POM152
YMR129W
4014 nt
3.31
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
DYN2
YDR424C
279 nt
3.3
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YLR146W-A
YLR146W-A
189 nt
3.3
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YLR154C-H
YLR154C-H
132 nt
3.3
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YLR156C-A
YLR156C-A
132 nt
3.3
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YLR157C-C
YLR157C-C
132 nt
3.3
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YLR159C-A
YLR159C-A
132 nt
3.3
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YAT2
YER024W
2772 nt
3.3
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
SEF1
YBL066C
3447 nt
3.29
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YGR050C
YGR050C
357 nt
3.29
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
RPB10
YOR210W
213 nt
3.29
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
MSB2
YGR014W
3921 nt
3.29
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
PFF1
YBR074W
2931 nt
3.29
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YHR071C-A
YHR071C-A
321 nt
3.28
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
YBR221W-A
YBR221W-A
105 nt
3.28
□□□□□ -1.88
MSN5
P52918
TSC11
YER093C
4293 nt
3.27
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
VTC3
YPL019C
2508 nt
3.27
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
YPL150W
YPL150W
2706 nt
3.27
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
YCR095W-A
YCR095W-A
159 nt
3.27
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
HYP2
YEL034W
474 nt
3.27
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
RPL33A
YPL143W
324 nt
3.27
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
AI2
Q0055
2565 nt
3.27
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
YIL142C-A
YIL142C-A
333 nt
3.26
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
YBR174C
YBR174C
315 nt
3.26
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
UBP11
YKR098C
2154 nt
3.26
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
MDV1
YJL112W
2145 nt
3.26
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
MET5
YJR137C
4329 nt
3.26
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
PHD1
YKL043W
1101 nt
3.25
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
CAF120
YNL278W
3183 nt
3.24
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
RRP12
YPL012W
3687 nt
3.24
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
YIL080W
YIL080W
4722 nt
3.24
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
POL2
YNL262W
6669 nt
3.24
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
YHR032W-A
YHR032W-A
180 nt
3.24
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
SPO75
YLL005C
2607 nt
3.24
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
DYN1
YKR054C
12279 nt
3.24
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
TAF2
YCR042C
4224 nt
3.23
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
YDL196W
YDL196W
330 nt
3.23
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
RGM1
YMR182C
636 nt
3.23
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
ATG11
YPR049C
3537 nt
3.23
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
NCA2
YPR155C
1851 nt
3.23
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
SWI6
YLR182W
2412 nt
3.23
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
BUD4
YJR092W
4344 nt
3.22
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
PMR1
YGL167C
2853 nt
3.22
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
SNF5
YBR289W
2718 nt
3.21
□□□□□ -1.89
MSN5
P52918
SPC98
YNL126W
2541 nt
3.21
□□□□□ -1.9
MSN5
P52918
NIP100
YPL174C
2607 nt
3.21
□□□□□ -1.9
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