Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRCA2P51587 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRCA2P51587 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms