Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDK7P50613 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDK7P50613 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDK7P50613 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDK7P50613 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDK7P50613 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms