Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV1P50549 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV1P50549 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV1P50549 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV1P50549 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms