Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CDK8P49336 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK8P49336 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK8P49336 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK8P49336 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK8P49336 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK8P49336 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK8P49336 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms