Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LHX1P48742 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LHX1P48742 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LHX1P48742 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LHX1P48742 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms