Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RXRGP48443 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms