Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GJA8P48165 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GJA8P48165 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GJA8P48165 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA8P48165 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA8P48165 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA8P48165 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA8P48165 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA8P48165 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms