Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPL29P47914 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPL29P47914 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms