Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GNPDA1P46926 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GNPDA1P46926 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms