Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRXP46100 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRXP46100 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRXP46100 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRXP46100 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms