Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRPHP41219 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPHP41219 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPHP41219 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPHP41219 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPHP41219 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPHP41219 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPHP41219 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms